手軽さならサイドバーへのドラッグ&ドロップが一番
従来の OS X ではファイル/フォルダの右クリックで表示されるコンテキストメニューから、あるいは情報ウインドウからラベルの色を設定する事ができました。
ラベルから "タグ" に変わった OS X Mavericks でも(多少の違いがあるものの)同じやり方で設定する事が可能ですが、新たに下図のようにサイドバーへドラッグ&ドロップしても設定できるようになっています。
サイドバーの任意のタグにファイルをドラッグ&ドロップ
ひとつのファイル/フォルダに "複数のタグ" を設定したい場合は情報ウインドウから行った方が楽ですが、逆に "複数のファイル/フォルダ" に共通するひとつのタグを一気に設定したい場合などに重宝します。
なお、複数のファイル/フォルダに、共通する複数のタグを、一気に……ということであれば、複数ファイルを選択して command+option+i で呼び出したインスペクタを使うのが最小の手順で済む便利な方法かと思います。
地味に色々便利なインスペクタ