2016年11月20日、Appleはごく一部のiPhone 6sで確認された『予期せずシャットダウン(電源が切れる)』問題に対し、バッテリーを無償で交換するプログラムの提供を開始する旨をアナウンスしています。
▶︎ iPhone 6s Program for Unexpected Shutdown Issues - Apple Support
プログラムが適用されるのは2015年9月〜10月に製造販売されたiPhone 6sのうちの所定のシリアル番号に該当するデバイスのみで、この製造期間以外、並びにiPhone 6s Plusはこのプログラムの適用範囲外となっています。
確認方法、プログラムの適用申請方法などは前述のページに記載されていますが、このエントリを書いている時点ではまだ英文のままなので、よく分からない場合は翻訳されるまで待つか、Appleテクニカルサポートを介して連絡をしてみてください。