OS X El Capitanにアップデートされていない環境からソフトウェア・アップデートの画面(Mac App Store)を開くと……
( 」・Д・)」 El Capitanにしちゃえば〜?
……と言わんばかりの大きなバナーがウインドウ上部に鎮座しています。
もしこのバナーが目障りだったらバナー上で右クリック(または control+クリック)をして表示された項目を選択してください。
これでOK ( ´▽`)d
ただし隠れるのはソフトウェア・アップデート画面のバナーのみで、他の画面に表示されるEl Capitanのバナーは通常通り表示され続けます。
source: How to Hide OS X El Capitan from Mac App Store | OSXDaily