通知を受けるか否か……ではなく、そもそも訊かれないようにする
以下の Safari (OS X) 環境設定画面で、プッシュ通知を受けるかどうかの確認ダイアログが表示されないようにすることが出来ます。
Safari 環境設定>通知
上図下辺にある "Web サイトがプッシュ通知送信のアクセス権限を求めることを許可" のチェックボックスをクリックしてチェックを外します。
デフォルトではこの項目にチェックが入っているので、プッシュ通知を提供しているサイトに初めて訪れると以下のダイアログが表示され通知を受けるかどうか訊ねられます。
(例)9 to 5 Mac を初訪問した例
プッシュ通知を提供しているサイトはまださほど多くはないし、ダイアログが出たところでどちらかのボタンをクリックしてしまえば次回以降は同サイトを訪れても確認ダイアログは出ないのでこの事を鬱陶しがる方はあまりいないと思いますが、どうしても邪魔なようなら上記方法で通知そのものが出ないようにしちゃいましょう。
なお、この項目が用意されているのは Safari 7.0.3 以降のようです。設定画面を開いても項目が見当たらない場合は OS X Security Update 2014-002 を適用し最新状態に更新してください。